22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0261 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  620  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  32.05 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  32.01 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  29.86 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  31.03 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  24.32 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  24.69 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  27.5 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  29.29 
 
 		 269 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  28.39 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  25.68 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  26.53 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  24.43 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  25 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  26.22 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  23.93 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  23.77 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  23.84 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6250  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6234  hypothetical protein  25.46 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  24.56 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2029  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.721418  normal  0.623981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>