47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3332 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3332  putative transmembrane protein  100 
 
 		 93 aa  183  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.551486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2985  hypothetical protein  95.7 
 
 		 93 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3050  hypothetical protein  89.25 
 
 		 93 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6725  putative transmembrane protein  74.19 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5371  putative transmembrane protein  70.97 
 
 		 93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0380  putative integral membrane protein  63.73 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000114703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0388  putative integral membrane protein  63.73 
 
 		 102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.293835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0608  putative integral membrane protein  60.78 
 
 		 102 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3672  putative integral membrane protein  61.76 
 
 		 102 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2318  putative integral membrane protein  60.78 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0560205  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1029  putative integral membrane protein  60.78 
 
 		 102 aa  116  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2205  putative integral membrane protein  59.8 
 
 		 102 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3392  putative integral membrane protein  56.86 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0482  putative integral membrane protein  52.94 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00104314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1444  hypothetical protein  55.68 
 
 		 92 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0121261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2090  hypothetical protein  67.16 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2230  hypothetical protein  55.88 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411171  normal  0.154087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0376  hypothetical protein  60.29 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148136  normal  0.453628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2046  small integral membrane protein-like protein  58.33 
 
 		 90 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0395838  normal  0.868714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1741  hypothetical protein  56.32 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472664  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3631  hypothetical protein  57.14 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1737  small integral membrane protein-like protein  49.41 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688593  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3736  hypothetical protein  57.35 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0639832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3170  hypothetical protein  56.72 
 
 		 90 aa  80.1  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.180027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5935  Protein of unknown function DUF2160, transmembrane  54.41 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.114344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4099  hypothetical protein  61.19 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645263  normal  0.5804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3981  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1596  hypothetical protein  58.33 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.644548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2226  hypothetical protein  54.93 
 
 		 109 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303465  normal  0.0656684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4890  hypothetical protein  53.52 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1970  small integral membrane protein-like protein  56.72 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1897  small integral membrane protein-like protein  51.76 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3474  small integral membrane protein-like protein  50.59 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603331 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0099  hypothetical protein  52.86 
 
 		 93 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00804392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1366  hypothetical protein  52.86 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0994067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4064  hypothetical protein  50.7 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5978  conserved hypothetical conserved membrane protein  54.17 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6465  conserved hypothetical conserved membrane protein  52.78 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.982762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2096  Protein of unknown function DUF2160, transmembrane  44.19 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4212  hypothetical protein  49.3 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2908  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1322  hypothetical protein  43.68 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2664  hypothetical protein  43.68 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4388  hypothetical protein  52.38 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2421  hypothetical protein  49.28 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00903724  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1202  small integral membrane protein-like protein  44.83 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3132  hypothetical protein  43.66 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>