10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2343 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2343  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  191  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0539871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2293  hypothetical protein  64.71 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0567352  unclonable  0.0000000000381377 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2376  hypothetical protein  63.1 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000039933  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2998  imidazoleglycerol-phosphate synthase  41.54 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2492  hypothetical protein  33.78 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2976  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1297  hypothetical protein  32 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0099  hypothetical protein  31.51 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4371  hypothetical protein  34.25 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000300106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2313  hypothetical protein  25.68 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.153075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>