37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1312 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1312  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  769    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0250798  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1376  hypothetical protein  94.09 
 
 
406 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379564  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4115  hypothetical protein  75.12 
 
 
406 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6465  hypothetical protein  73.15 
 
 
406 aa  521  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0543  hypothetical protein  73.65 
 
 
406 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.939754  normal  0.330299 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1896  hypothetical protein  72.41 
 
 
406 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2027  hypothetical protein  72.91 
 
 
406 aa  512  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5692  hypothetical protein  69.95 
 
 
406 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0354  hypothetical protein  69.73 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856052  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3202  hypothetical protein  73.4 
 
 
407 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480784  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2553  hypothetical protein  73.15 
 
 
406 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1994  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  70.94 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739767  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6083  helix-turn-helix, type 11  70.94 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92562  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5304  hypothetical protein  73.15 
 
 
406 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.967801  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2054  hypothetical protein  72.91 
 
 
406 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594988  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2671  hypothetical protein  71.92 
 
 
406 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0727774  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2014  hypothetical protein  70.69 
 
 
406 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2341  hypothetical protein  71.43 
 
 
406 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0024  hypothetical protein  74.38 
 
 
406 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1331  putative transcriptional regulator, CadC  69.62 
 
 
406 aa  479  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.900244  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1282  hypothetical protein  70.94 
 
 
406 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0406727  normal  0.439874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6460  hypothetical protein  67.83 
 
 
406 aa  458  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.678731  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2027  peptidase cysteine peptidase active site  70.03 
 
 
367 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3285  hypothetical protein  70.03 
 
 
367 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0992  tetratricopeptide TPR_4  64.34 
 
 
406 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4057  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  61.1 
 
 
406 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4849  tetratricopeptide TPR_4  65.93 
 
 
407 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2358  hypothetical protein  63.53 
 
 
414 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634476  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3151  tetratricopeptide TPR_4  60 
 
 
419 aa  350  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0081  tetratricopeptide TPR_4  59.9 
 
 
408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6319  Tetratricopeptide TPR_4  59.61 
 
 
406 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3200  TPR repeat-containing protein  58.35 
 
 
406 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0345  hypothetical protein  54.71 
 
 
416 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3607  hypothetical protein  58.31 
 
 
421 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0374  hypothetical protein  56.23 
 
 
414 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0361  hypothetical protein  56.23 
 
 
415 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0254485  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  28.05 
 
 
785 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>