14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1781 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1781  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  236  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.670787  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2105  hypothetical protein  97.35 
 
 		 113 aa  229  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0449217  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1958  hypothetical protein  82.3 
 
 		 113 aa  199  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5662  hypothetical protein  76.11 
 
 		 113 aa  184  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340656 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1592  hypothetical protein  68.14 
 
 		 109 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2870  hypothetical protein  66.37 
 
 		 109 aa  165  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1329  hypothetical protein  65.49 
 
 		 109 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2349  hypothetical protein  68.14 
 
 		 109 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4237  hypothetical protein  63.72 
 
 		 109 aa  153  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0973  hypothetical protein  61.95 
 
 		 109 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.784027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3106  hypothetical protein  61.06 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2923  hypothetical protein  48.67 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.373188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4252  hypothetical protein  57.69 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.818671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3677  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>