24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1580 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1580  putative signal peptide protein  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171314  normal  0.0540175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1909  putative signal peptide protein  93.52 
 
 		 247 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.42684  normal  0.0790998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1638  putative signal peptide protein  67.86 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1354  putative signal peptide protein  49.71 
 
 		 209 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1363  putative signal peptide protein  45.73 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0976  hypothetical protein  41.28 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1851  hypothetical protein  39.25 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388772  normal  0.0532446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2334  hypothetical protein  38.32 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0633948  normal  0.0979619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1720  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1692  hypothetical protein  37.84 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5079  hypothetical protein  38.68 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6299  hypothetical protein  39.78 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1780  hypothetical protein  39.78 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.507226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1490  hypothetical protein  37.27 
 
 		 181 aa  72  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0740119  normal  0.142837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2262  hypothetical protein  35.96 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.992571  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1805  hypothetical protein  37.38 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.409746 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1315  hypothetical protein  37.14 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.713516  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1075  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0092  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.228911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1804  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.546944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2196  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2159  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0817794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2324  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3139  hypothetical protein  40.98 
 
 		 144 aa  42  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>