17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0689 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  222  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  65.81 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  64.1 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  60.19 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  65.81 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  55.93 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  52.29 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  53.27 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  52.25 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  49.53 
 
 		 123 aa  85.9  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  47.37 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  39.13 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  32.11 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  33.65 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0847  hypothetical protein  31.34 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>