16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2359 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  224  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  90.6 
 
 		 119 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  77.98 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  75.21 
 
 		 123 aa  157  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  77.78 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  70.25 
 
 		 123 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  65.79 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  64.91 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  55.66 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  62.28 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  56.64 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  55.75 
 
 		 116 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  38.04 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  40.86 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>