11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1427 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0847  hypothetical protein  47.54 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  34.21 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  32.11 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  32.26 
 
 		 114 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  32.18 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  28.57 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  33.65 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  31.94 
 
 		 119 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  32.43 
 
 		 117 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>