14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4718 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4718  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  283  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1352  hypothetical protein  88.97 
 
 		 159 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1372  hypothetical protein  86.76 
 
 		 136 aa  253  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4044  hypothetical protein  72.26 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1920  hypothetical protein  70.31 
 
 		 133 aa  193  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4031  hypothetical protein  57.6 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  0.020129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2230  hypothetical protein  44.96 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2607  hypothetical protein  42.06 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3595  hypothetical protein  47.37 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521836  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0425  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0419  hypothetical protein  42.31 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0797  hypothetical protein  37.82 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0743  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2896  hypothetical protein  33.06 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039157  decreased coverage  0.00427012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>