23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3569 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3569  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3337  hypothetical protein  76.6 
 
 		 91 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3071  hypothetical protein  76.74 
 
 		 91 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0905739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2383  hypothetical protein  72.63 
 
 		 91 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0573572  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2430  hypothetical protein  67.02 
 
 		 89 aa  120  6e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1707  hypothetical protein  62.77 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123463  normal  0.276105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4459  hypothetical protein  42.22 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218625  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3000  hypothetical protein  46.99 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.664026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3189  hypothetical protein  46.99 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3225  hypothetical protein  46.99 
 
 		 87 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2744  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.461077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2241  hypothetical protein  45.35 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1889  hypothetical protein  45.78 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.503768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0374  hypothetical protein  40.21 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.403267 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1562  hypothetical protein  44.58 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.948556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3333  hypothetical protein  38.37 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0961  hypothetical protein  38.67 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.570752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1931  hypothetical protein  40.98 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154345  hitchhiker  0.0000000596513 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0557  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2220  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2903  hypothetical protein  31.17 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.520139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6119  hypothetical protein  40.28 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14420  hypothetical protein  29.47 
 
 		 98 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>