17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3013 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3013  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2644  hypothetical protein  87.5 
 
 		 80 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2359  hypothetical protein  83.75 
 
 		 81 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.51473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4244  hypothetical protein  85.14 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0272  hypothetical protein  70 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3615  hypothetical protein  73.97 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  58.21 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  54.93 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  54.93 
 
 		 80 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  52.11 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  50.7 
 
 		 80 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  53.12 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  50.7 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1470  hypothetical protein  43.75 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  39.44 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  38.1 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>