33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0493 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  81.03 
 
 		 296 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  75.18 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  69.08 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  62.5 
 
 		 286 aa  354  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  66.12 
 
 		 258 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  56.12 
 
 		 289 aa  331  7.000000000000001e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  42.91 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  35.93 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  35.5 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  33.82 
 
 		 298 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  33.88 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  35.34 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  33.47 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  32.18 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  31.13 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  32.02 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  30.96 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  32.62 
 
 		 263 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  30.29 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  30.83 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  30.08 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  25.78 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  30.71 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  26.48 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  26.48 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  25.42 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  31.3 
 
 		 259 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  24.37 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  25.23 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  25.23 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  52.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  21.49 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>