26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1857 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  66.95 
 
 		 698 aa  952    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  100 
 
 		 711 aa  1474    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  66.76 
 
 		 699 aa  941    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  37.67 
 
 		 699 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  37.71 
 
 		 698 aa  386  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  38.09 
 
 		 712 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  27.46 
 
 		 950 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  25.33 
 
 		 744 aa  108  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  25.99 
 
 		 756 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  31.49 
 
 		 719 aa  90.9  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  34.78 
 
 		 666 aa  85.1  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  29.27 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  26.82 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  28.32 
 
 		 661 aa  62  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  29.26 
 
 		 670 aa  61.6  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  25.39 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  26.4 
 
 		 339 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  33.09 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  35.05 
 
 		 330 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  32.82 
 
 		 321 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1679  hypothetical protein  26.67 
 
 		 501 aa  51.6  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.6131  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  38.81 
 
 		 390 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  25.36 
 
 		 357 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1148  hypothetical protein  24.12 
 
 		 796 aa  45.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  26.98 
 
 		 719 aa  44.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>