27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1366 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1366  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.719632  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3573  hypothetical protein  87.86 
 
 
206 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.140282  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2011  thioredoxin-like protein  34.13 
 
 
200 aa  93.2  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.113065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1986  hypothetical protein  34.15 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2019  hypothetical protein  34.15 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.303604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0820  hypothetical protein  34.09 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.337981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1111  hypothetical protein  34.25 
 
 
184 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.691511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1297  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554451  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1269  thioredoxin  38.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.517108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1271  thioredoxin  38.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0361356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1404  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1437  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.875114  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1504  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1543  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0188875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1475  hypothetical protein  38.14 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1307  thioredoxin  38.14 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3907  hypothetical protein  37.11 
 
 
184 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1281  hypothetical protein  39.29 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0571  hypothetical protein  37.93 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04560  hypothetical protein  25.58 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0483659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2827  hypothetical protein  34.38 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4036  hypothetical protein  32.31 
 
 
206 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5973  hypothetical protein  31.91 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3780  hypothetical protein  29.46 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.41238  normal  0.142422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3348  hypothetical protein  33.72 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0850348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3340  hypothetical protein  31.18 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.965688  normal  0.0203534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4153  hypothetical protein  27.74 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.270226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>