10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_R0047 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_R0047    100 
 
 		 263 bp  521  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3503  hypothetical protein  97.3 
 
 		 246 bp  65.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188544  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0034    97.22 
 
 		 267 bp  63.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0044    94.74 
 
 		 250 bp  60  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.966315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2504  hypothetical protein  94.74 
 
 		 948 bp  60  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475199  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  96.97 
 
 		 2466 bp  58  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0012    100 
 
 		 221 bp  52  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5656  Cobalamin-3  100 
 
 		 215 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0302962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2721  hypothetical protein  100 
 
 		 213 bp  48.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.343194 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2410  cobalamin biosynthesis protein CbiG  100 
 
 		 957 bp  46.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00863167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>