14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5217 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5217  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5216  hypothetical protein  34.6 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21306 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0781  hypothetical protein  32.64 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0858  hypothetical protein  31.61 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2610  hypothetical protein  34.5 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6947  hypothetical protein  31.58 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5629  hypothetical protein  35.34 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0524  hypothetical protein  29.52 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0334613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30470  hypothetical protein  32.17 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1177  hypothetical protein  30.06 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3199  hypothetical protein  32.67 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3495  hypothetical protein  31.29 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  38.2 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.37 
 
 		 702 aa  50.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>