15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2162 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  911    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  34.38 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  29.15 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  29.6 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3857  hypothetical protein  28.2 
 
 		 473 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00220311 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  39.81 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  34.69 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  29.41 
 
 		 329 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  32.79 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0103  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887161  hitchhiker  0.0000190274 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  30.91 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  32.65 
 
 		 154 aa  57  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  27.88 
 
 		 315 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  30.21 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1371  hypothetical protein  35.14 
 
 		 263 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>