24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1547 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1547  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00175171  normal  0.932168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3722  putative lipoprotein  84.78 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1892  putative lipoprotein  84.78 
 
 		 92 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2915  putative lipoprotein  84.78 
 
 		 92 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1337  hypothetical protein  77.17 
 
 		 92 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0469662  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2347  putative lipoprotein  75 
 
 		 88 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.629232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2001  putative lipoprotein  72.83 
 
 		 88 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2063  putative lipoprotein  71.74 
 
 		 87 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1279  putative lipoprotein  67.39 
 
 		 87 aa  129  9e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35750  lipoprotein  68.82 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3709  putative lipoprotein  68.48 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2587  lipoprotein  70.65 
 
 		 87 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0723  putative lipoprotein  65.22 
 
 		 88 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35840  lipoprotein  64.13 
 
 		 87 aa  103  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.300503  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0809  hypothetical protein  55.43 
 
 		 104 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.910435  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4192  hypothetical protein  63.53 
 
 		 80 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0332  putative lipoprotein  69.64 
 
 		 59 aa  76.6  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.907733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3509  hypothetical protein  48.72 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0441  hypothetical protein  49.33 
 
 		 72 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1315  hypothetical protein  51.28 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2642  hypothetical protein  44.3 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2702  putative lipoprotein  65.85 
 
 		 51 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2579  lipoprotein  45.16 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1287  putative lipoprotein  49.09 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>