48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1394 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1394  acyl-CoA-binding protein  100 
 
 		 89 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971038  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1940  acyl-CoA-binding protein AcbP  82.56 
 
 		 89 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0466887  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1305  acyl-coA-binding protein ACBP  82.56 
 
 		 89 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150747  normal  0.170816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1239  acyl-coA-binding protein ACBP  81.4 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451854  normal  0.84636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1366  acyl-CoA-binding protein  73.03 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.322711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1231  acyl-CoA-binding protein  69.66 
 
 		 89 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.269676  normal  0.162101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2078  acyl-CoA-binding protein  67.42 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2065  acyl-CoA-binding protein  68.54 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.662917 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1947  acyl-CoA-binding protein  67.42 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2046  acyl-CoA-binding protein  68.54 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6031  acyl-CoA-binding protein  68.54 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.783486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5355  Acyl-CoA-binding protein, ACBP  67.42 
 
 		 89 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2000  acyl-CoA-binding protein  64.04 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2522  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.197859  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2466  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1583  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1358  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.249509  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3227  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.457766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2611  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2085  acyl-CoA-binding protein  62.92 
 
 		 89 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.034  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1653  putative acyl-CoA-binding protein  59.55 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192969  normal  0.0201312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2484  acyl-coA-binding protein ACBP  58.43 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515409  hitchhiker  0.000620664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1366  acyl-CoA-binding protein  60.67 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3532  acyl-CoA-binding protein  56.63 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3509  acyl-CoA-binding protein  59.04 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4041  acyl-CoA-binding protein  55.42 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3085  putative acyl-CoA-binding protein  56.63 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0123  acyl-coA-binding protein ACBP  55.42 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000000595584  decreased coverage  0.0000109119 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1134  acyl-CoA-binding protein  53.01 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0455  acyl-CoA-binding protein  53.01 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.628298  normal  0.491613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0446  acyl-coA-binding protein ACBP  53.01 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.330336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0394  acyl-CoA-binding protein  54.32 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0103  acyl-CoA-binding protein  51.16 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000596303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0347  acyl-coA-binding protein ACBP  51.81 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4032  acyl-coA-binding protein ACBP  52.44 
 
 		 86 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000477077  normal  0.553982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0773  acyl-CoA-binding protein  50.6 
 
 		 84 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0859936  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31029  predicted protein  56.34 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.744138  normal  0.12604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3734  acyl-CoA-binding protein  48.24 
 
 		 86 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0342  acyl-CoA-binding protein  56.06 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3254  acyl-CoA-binding protein  46.34 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.264963  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01420  long-chain fatty acid transporter, putative  42.7 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32604  predicted protein  42.11 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000696357  normal  0.053185 
 
 
-
 
NC_006686  CND03160  long-chain fatty acid transporter, putative  39.34 
 
 		 406 aa  53.5  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05904  Acyl CoA binding protein family (AFU_orthologue; AFUA_2G11060)  33.73 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.979863 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48778  predicted protein  39.74 
 
 		 351 aa  47  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01062  Acyl CoA binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12300)  40.26 
 
 		 376 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0773441 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34529  predicted protein  31.07 
 
 		 394 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2596  acyl-CoA-binding protein  32.14 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>