29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1032 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1032  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  713    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6008  hypothetical protein  58.58 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1066  hypothetical protein  55.1 
 
 		 354 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1407  hypothetical protein  46.65 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54896  normal  0.251254 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2217  hypothetical protein  43.58 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.685913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2799  hypothetical protein  44.38 
 
 		 333 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2666  hypothetical protein  44.07 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0020  hypothetical protein  48.81 
 
 		 315 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5981  hypothetical protein  43.83 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589392  normal  0.48413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0549  hypothetical protein  44.95 
 
 		 333 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2750  hypothetical protein  44.04 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2137  hypothetical protein  44.04 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2775  hypothetical protein  43.43 
 
 		 333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3423  hypothetical protein  45.57 
 
 		 350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0663  hypothetical protein  45.83 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0825  hypothetical protein  45.83 
 
 		 340 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2895  hypothetical protein  45.83 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2190  hypothetical protein  45.83 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2517  hypothetical protein  45.83 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0049  hypothetical protein  45.83 
 
 		 299 aa  272  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0649  hypothetical protein  45.49 
 
 		 340 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1192  hypothetical protein  38.66 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0973  hypothetical protein  35.76 
 
 		 330 aa  188  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1131  hypothetical protein  31 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.238037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1120  hypothetical protein  30.67 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1676  hypothetical protein  29.67 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1225  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1704  hypothetical protein  30 
 
 		 337 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1767  hypothetical protein  24.91 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>