8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_7019 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  88.02 
 
 
1065 bp  1003    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  88.24 
 
 
1053 bp  995    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7019    100 
 
 
1037 bp  2056    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  81.11 
 
 
1050 bp  141  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5199    83.64 
 
 
497 bp  113  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4242    84.09 
 
 
234 bp  95.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4885    90.24 
 
 
985 bp  50.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  93.75 
 
 
1041 bp  48.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>