32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6781 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6781  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.406722  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5906  hypothetical protein  71.26 
 
 
110 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4526  hypothetical protein  65.52 
 
 
123 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.540117 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1063  hypothetical protein  63.64 
 
 
104 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.513514  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2289  hypothetical protein  63.04 
 
 
175 aa  120  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1333  hypothetical protein  61.96 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.784002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00670  hypothetical protein  63.04 
 
 
122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2985  hypothetical protein  61.96 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3110  hypothetical protein  61.96 
 
 
125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1344  hypothetical protein  61.11 
 
 
122 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.431742  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6485  hypothetical protein  61.11 
 
 
122 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0097127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5768  hypothetical protein  64.04 
 
 
109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.959428 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6338  hypothetical protein  60 
 
 
118 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.864224  normal  0.10452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6075  hypothetical protein  61.11 
 
 
124 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0756645 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5608  hypothetical protein  60 
 
 
118 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5478  hypothetical protein  62.92 
 
 
118 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279518 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1598  hypothetical protein  58.89 
 
 
92 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1295  hypothetical protein  63.22 
 
 
92 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920283  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4293  hypothetical protein  59.77 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3717  hypothetical protein  57.61 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0793  hypothetical protein  60.92 
 
 
102 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.321671  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0837  hypothetical protein  59.77 
 
 
100 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4511  hypothetical protein  57.65 
 
 
109 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1159  hypothetical protein  55.43 
 
 
128 aa  104  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5447  hypothetical protein  55.43 
 
 
129 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4202  hypothetical protein  54.02 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529843  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4312  hypothetical protein  54.02 
 
 
118 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257675  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5292  hypothetical protein  52.81 
 
 
142 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.109135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2127  hypothetical protein  54.88 
 
 
94 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2153  hypothetical protein  56.1 
 
 
94 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1866  hypothetical protein  63.24 
 
 
75 aa  92  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3634  hypothetical protein  59.62 
 
 
54 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00027053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>