19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3514 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  44.7 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  43.85 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  41.04 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  41.18 
 
 		 137 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  41.22 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  38.93 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  38.93 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  39.26 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  39.55 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  34.81 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  31.06 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  30.53 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  28.78 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  26.87 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  26.87 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1712  hypothetical protein  25.95 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  27.39 
 
 		 163 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>