30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3204 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3204  TfuA domain protein core  100 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2956  TfuA domain protein core  84.26 
 
 
235 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4529  TfuA domain-containing protein  50.43 
 
 
234 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6038  TfuA domain protein core  45.49 
 
 
247 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345548  normal  0.623723 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7196  TfuA domain protein core  45.49 
 
 
247 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.0994766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3471  TfuA domain-containing protein  47.83 
 
 
451 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2262  TfuA-like  44.55 
 
 
238 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1332  TfuA domain-containing protein  42.58 
 
 
217 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1977  TfuA domain-containing protein  40.85 
 
 
216 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0265574  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6311  TfuA domain protein core  42.65 
 
 
464 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0918  TfuA domain-containing protein  44.17 
 
 
411 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124979  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2070  TfuA-like protein  37.91 
 
 
214 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1210  TfuA domain protein core  39.32 
 
 
208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0526  TfuA-like, core  38.39 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1402  TfuA domain-containing protein  41.97 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0861  TfuA-like protein  41.62 
 
 
403 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.060609  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0014  hypothetical protein  36.19 
 
 
344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.175575  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0590  hypothetical protein  35.89 
 
 
213 aa  125  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0804976  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0010  hypothetical protein  37.76 
 
 
344 aa  124  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0428  TfuA domain-containing protein  31.91 
 
 
218 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0355  TfuA domain-containing protein  30.19 
 
 
214 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00180468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11405  hypothetical protein  34.95 
 
 
497 aa  105  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000176066  normal  0.617932 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6107  TfuA domain-containing protein  33.66 
 
 
456 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620154  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0481  TfuA domain-containing protein  29.25 
 
 
214 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0822  hypothetical protein  35.24 
 
 
219 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1564  TfuA domain-containing protein  28.77 
 
 
214 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1989  TfuA domain-containing protein  38.39 
 
 
258 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0910  TfuA domain protein core  40.2 
 
 
403 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0906  TfuA domain protein core  39.09 
 
 
402 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.976855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  35.48 
 
 
882 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>