170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3167 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  100 
 
 
313 aa  642    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  96.49 
 
 
313 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  77.24 
 
 
321 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  74.04 
 
 
313 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  59.94 
 
 
313 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  56.91 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  56.91 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  56.91 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  56.91 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  56.91 
 
 
313 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  56.09 
 
 
313 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  55.63 
 
 
313 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  55.31 
 
 
343 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  56.27 
 
 
313 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  55.31 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  55.31 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  55.31 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  55.31 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  55.31 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  55.95 
 
 
313 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  55.31 
 
 
313 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  53.67 
 
 
314 aa  357  9.999999999999999e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  53.05 
 
 
313 aa  353  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  53.38 
 
 
313 aa  339  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  49.52 
 
 
315 aa  325  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2115  hypothetical protein  49.68 
 
 
313 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.107173  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  44.19 
 
 
316 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  44.19 
 
 
316 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  43.87 
 
 
316 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  43.91 
 
 
314 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  43.63 
 
 
316 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  43.27 
 
 
314 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  43.09 
 
 
313 aa  252  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  43.13 
 
 
315 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  43.59 
 
 
314 aa  248  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  41.16 
 
 
315 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  42.01 
 
 
319 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  42.31 
 
 
314 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  42.95 
 
 
314 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  41.67 
 
 
314 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  42.95 
 
 
319 aa  245  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  41.99 
 
 
314 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  42.54 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  42.63 
 
 
314 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  42.95 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  42.95 
 
 
314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  41.04 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  42.86 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  38.66 
 
 
320 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  38.22 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  38.14 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  38.1 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  35.87 
 
 
318 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  36.83 
 
 
319 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  37.94 
 
 
315 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  34.27 
 
 
325 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  36.66 
 
 
316 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  36.88 
 
 
324 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  37.03 
 
 
318 aa  205  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  36.1 
 
 
320 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0520  hypothetical protein  37.9 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582097  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  32.91 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  36.05 
 
 
317 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  34.94 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  35.69 
 
 
316 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  33.55 
 
 
334 aa  195  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  36.01 
 
 
316 aa  195  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  36.22 
 
 
317 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  35.03 
 
 
316 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  34.91 
 
 
322 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  34.91 
 
 
322 aa  192  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  34.19 
 
 
313 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  33.44 
 
 
329 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  34.71 
 
 
316 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  34.71 
 
 
316 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  34.39 
 
 
316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  35.33 
 
 
319 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11431  hypothetical protein  33.87 
 
 
313 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11441  hypothetical protein  33.87 
 
 
313 aa  189  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  35 
 
 
322 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  32.5 
 
 
318 aa  187  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  35.33 
 
 
316 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2265  hypothetical protein  32.59 
 
 
327 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  32.48 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  35.46 
 
 
316 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2637  hypothetical protein  34.18 
 
 
331 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37252  normal  0.66457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  33.76 
 
 
316 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  32.48 
 
 
321 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  35.02 
 
 
319 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  34.08 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15701  hypothetical protein  33.97 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  33.88 
 
 
308 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  34.29 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  33.97 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0732  hypothetical protein  33.88 
 
 
324 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.109994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  31.19 
 
 
324 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3575  hypothetical protein  34.18 
 
 
318 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  33.97 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0363  hypothetical protein  32.58 
 
 
309 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2244  protein of unknown function DUF403  30.45 
 
 
333 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>