53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3020 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  100 
 
 		 86 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  98.82 
 
 		 86 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  80 
 
 		 91 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  73.17 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  73.26 
 
 		 102 aa  124  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  71.95 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  70.73 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  70.73 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  65.06 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  64.2 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  62.96 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  60.24 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  67.09 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  58.82 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  62.34 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  59.04 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  59.04 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  60.26 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  57.5 
 
 		 107 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  53.09 
 
 		 93 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  55.56 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  51.25 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  60 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  58.67 
 
 		 87 aa  86.3  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  50.62 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  50.62 
 
 		 93 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  52.63 
 
 		 94 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  62.96 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  47.95 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  48.61 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  38.16 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  45.21 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  41.77 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  44.59 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  40.51 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  36 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  44.23 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  32.47 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0356  hypothetical protein  48.84 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3099  hypothetical protein  36.05 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0304  hypothetical protein  34.21 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0459  hypothetical protein  30.77 
 
 		 86 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0462985  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 86 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6031  hypothetical protein  37.1 
 
 		 86 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>