34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3004 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  100 
 
 
150 aa  308  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  87.82 
 
 
155 aa  234  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  54 
 
 
138 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  46.98 
 
 
129 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  31.84 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  32.43 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  40.52 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  30.98 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0987  hypothetical protein  38.46 
 
 
172 aa  49.7  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.283754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  69.23 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  52.94 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  64.29 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  65.38 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  65.38 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  48.84 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  54.84 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  51.35 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  61.54 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  45.45 
 
 
201 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  54.84 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  47.92 
 
 
209 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  60.71 
 
 
230 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  65.38 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  61.54 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  54.84 
 
 
141 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  61.54 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  65.38 
 
 
235 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1352  hypothetical protein  34.78 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.157036 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  61.54 
 
 
211 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  61.54 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  26.71 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5715  hypothetical protein  30.48 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  51.72 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2298  hypothetical protein  30.48 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>