26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5124 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5124  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5720  hypothetical protein  87.88 
 
 
66 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175303  normal  0.62585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0702  hypothetical protein  86.36 
 
 
66 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11135  hypothetical protein  60.32 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6100  antitoxin of a toxin/antitoxin system  54.84 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.192956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4678  hypothetical protein  52.31 
 
 
78 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3047  hypothetical protein  52.31 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251694  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5319  hypothetical protein  52.31 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4949  hypothetical protein  52.31 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.398097  decreased coverage  0.00607131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0410  hypothetical protein  50.79 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6033  antitoxin of a toxin/antitoxin system  50 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0230  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0330  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1290  hypothetical protein  47.69 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.5712  unclonable  0.000000000018273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1579  hypothetical protein  47.69 
 
 
65 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3864  hypothetical protein  48.39 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.429086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0611  hypothetical protein  47.69 
 
 
65 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6159  antitoxin of a toxin/antitoxin system  46.77 
 
 
65 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4801  hypothetical protein  42.62 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3924  hypothetical protein  47.69 
 
 
65 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.425499  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  43.08 
 
 
68 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0074  hypothetical protein  41.54 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.908723  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  41.54 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5816  hypothetical protein  47.54 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595083  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0631  hypothetical protein  38.71 
 
 
68 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0851  hypothetical protein  38.1 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>