24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4969 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4969    100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 984 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 462 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  90.57 
 
 		 951 bp  131  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  96.1 
 
 		 990 bp  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  96.1 
 
 		 861 bp  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  96.1 
 
 		 990 bp  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  96.1 
 
 		 990 bp  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  92.21 
 
 		 966 bp  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1702  hypothetical protein  92.45 
 
 		 249 bp  73.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2999    90.16 
 
 		 405 bp  73.8  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 960 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  87.5 
 
 		 960 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  87.5 
 
 		 513 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  87.5 
 
 		 960 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  87.5 
 
 		 960 bp  56  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    87.27 
 
 		 980 bp  54  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>