24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4644 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4644  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.844377 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3727  hypothetical protein  65.37 
 
 
410 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.291811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0373  hypothetical protein  46.63 
 
 
416 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1134  hypothetical protein  47.69 
 
 
411 aa  351  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1246  hypothetical protein  47.69 
 
 
411 aa  351  2e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.422175  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3508  hypothetical protein  46.47 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1278  hypothetical protein  45.99 
 
 
411 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815618  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2152  hypothetical protein  25.67 
 
 
419 aa  84  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1399  hypothetical protein  23.08 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.936893 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5234  hypothetical protein  21.8 
 
 
443 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0275  hypothetical protein  24.16 
 
 
582 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1740  hypothetical protein  21.19 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130481  normal  0.345273 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1166  hypothetical protein  23.19 
 
 
584 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.981297  normal  0.431954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1326  hypothetical protein  23.67 
 
 
584 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.157245  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0998  hypothetical protein  21.82 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0145  hypothetical protein  21.47 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.955464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0503  hypothetical protein  21.47 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2312  hypothetical protein  21.47 
 
 
516 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1389  hypothetical protein  21.47 
 
 
519 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1084  hypothetical protein  21.55 
 
 
521 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4221  hypothetical protein  23.05 
 
 
424 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.287374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 
425 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  21.48 
 
 
368 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  34.44 
 
 
404 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>