19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3219 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  45.45 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  46.97 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  47.37 
 
 		 132 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  40.15 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  45.8 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  41.22 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  41.18 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  42.31 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  38.93 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  38.17 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  26.36 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  29.81 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  24.62 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  27.04 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2539  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00977355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>