53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2757 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  100 
 
 
86 aa  168  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  98.82 
 
 
86 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  80 
 
 
91 aa  130  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  74.39 
 
 
96 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  73.17 
 
 
106 aa  123  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  71.95 
 
 
106 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  71.95 
 
 
106 aa  122  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  74.39 
 
 
102 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  63.86 
 
 
92 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  61.45 
 
 
85 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  62.96 
 
 
96 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  63.64 
 
 
91 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  61.73 
 
 
92 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  67.09 
 
 
109 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  57.65 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  60.24 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  56.47 
 
 
85 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  57.83 
 
 
84 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  58.75 
 
 
107 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  54.32 
 
 
93 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  59.49 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  57.89 
 
 
96 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  58.67 
 
 
79 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  51.25 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  51.85 
 
 
93 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  51.85 
 
 
93 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  56.41 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  56.41 
 
 
82 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  58.67 
 
 
82 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  57.33 
 
 
87 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  58.67 
 
 
80 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  52.63 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  60.47 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  47.95 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  48.61 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  39.47 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  43.04 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  45.21 
 
 
117 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  37.33 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  33.77 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  44.59 
 
 
83 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  44.23 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  39.24 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  45.95 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3099  hypothetical protein  36.47 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0459  hypothetical protein  32.05 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0462985  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0520  hypothetical protein  32.05 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  34.67 
 
 
83 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0356  hypothetical protein  46.51 
 
 
84 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  33.77 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  36.84 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2020  protein of unknown function DUF526  34.21 
 
 
87 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.271189  normal  0.774588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2390  hypothetical protein  34.21 
 
 
87 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>