13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0008 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1054  hypothetical protein  85.71 
 
 		 70 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.127693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4240  hypothetical protein  68.12 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1577  hypothetical protein  67.69 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2565  hypothetical protein  66.15 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382416  normal  0.0961796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3030  hypothetical protein  62.5 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.299577  normal  0.851885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2604  hypothetical protein  57.97 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0231  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2673  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09950  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.698592  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12560  hypothetical protein  48.84 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3743  hypothetical protein  46.38 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1143  hypothetical protein  48.84 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>