29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6008 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6008  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0903949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1032  hypothetical protein  55.93 
 
 
348 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1066  hypothetical protein  49.68 
 
 
354 aa  293  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2750  hypothetical protein  43.94 
 
 
333 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2137  hypothetical protein  43.94 
 
 
333 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2775  hypothetical protein  43.64 
 
 
333 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0549  hypothetical protein  43.47 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3423  hypothetical protein  41.69 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5981  hypothetical protein  41.09 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.589392  normal  0.48413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1407  hypothetical protein  42.33 
 
 
326 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54896  normal  0.251254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2666  hypothetical protein  42.81 
 
 
333 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2799  hypothetical protein  42.81 
 
 
333 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2217  hypothetical protein  41.64 
 
 
337 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.685913  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0049  hypothetical protein  43.94 
 
 
299 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2895  hypothetical protein  43.94 
 
 
340 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2190  hypothetical protein  43.94 
 
 
340 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2517  hypothetical protein  43.94 
 
 
340 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0020  hypothetical protein  42.68 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315274 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0649  hypothetical protein  43.6 
 
 
340 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0663  hypothetical protein  44.1 
 
 
340 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0825  hypothetical protein  44.1 
 
 
340 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1192  hypothetical protein  40.51 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0973  hypothetical protein  35.55 
 
 
330 aa  178  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1704  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1225  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939145  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1676  hypothetical protein  30.71 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.617002  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1120  hypothetical protein  31.07 
 
 
337 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1131  hypothetical protein  31.43 
 
 
337 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.238037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1767  hypothetical protein  26.27 
 
 
347 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>