13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1767 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  83.8 
 
 
435 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  100 
 
 
428 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  80.94 
 
 
434 aa  707    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  24 
 
 
472 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  24.15 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  23.1 
 
 
453 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  23.34 
 
 
483 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  21.07 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  22.68 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  22.58 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  22.32 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  22.32 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  21.08 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>