28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0732 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  60.42 
 
 
254 aa  312  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  44.96 
 
 
246 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  36.48 
 
 
242 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  36.36 
 
 
242 aa  141  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  34.54 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  33.47 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  31.82 
 
 
494 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  31.4 
 
 
241 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
253 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.62 
 
 
243 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  30.24 
 
 
504 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  31.62 
 
 
253 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 
245 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.97 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  24.42 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  24.41 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  24.71 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  23.39 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  23.85 
 
 
246 aa  62  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  23.02 
 
 
240 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  25.61 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  24.1 
 
 
548 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  25.1 
 
 
529 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03545  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  25.97 
 
 
336 aa  45.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1064  nucleotidyl transferase  26.17 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  25.54 
 
 
231 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>