25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3290 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  89.51 
 
 		 698 aa  1309    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  66.76 
 
 		 711 aa  941    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1451    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  39.29 
 
 		 698 aa  404  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  39.6 
 
 		 699 aa  405  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  39.35 
 
 		 712 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  28.15 
 
 		 950 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  26.63 
 
 		 756 aa  117  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  25.38 
 
 		 744 aa  104  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  33.59 
 
 		 719 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  32.96 
 
 		 666 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  27 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  30.98 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  27.21 
 
 		 882 aa  73.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  28.27 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  27.95 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  25.56 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1679  hypothetical protein  25.4 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.6131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  31.76 
 
 		 330 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  27.31 
 
 		 719 aa  51.2  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  33.94 
 
 		 319 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  25.85 
 
 		 357 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  32.28 
 
 		 321 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1148  hypothetical protein  25.84 
 
 		 796 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  32.18 
 
 		 294 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>