21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3289 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  94.42 
 
 		 698 aa  1360    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  72.38 
 
 		 712 aa  978    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  100 
 
 		 699 aa  1450    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  39.6 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  39.15 
 
 		 698 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  37.67 
 
 		 711 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1006  hypothetical protein  27.16 
 
 		 950 aa  134  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.601621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  25.65 
 
 		 756 aa  99  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  31.06 
 
 		 719 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0140  protein of unknown function DUF324  24.62 
 
 		 615 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  24.04 
 
 		 670 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  27.21 
 
 		 666 aa  77.4  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0183  cold-shock DNA-binding protein family protein  28.41 
 
 		 882 aa  75.5  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2524  hypothetical protein  27.04 
 
 		 744 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1246  hypothetical protein  25.26 
 
 		 719 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.534306  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  26.48 
 
 		 319 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  28.71 
 
 		 321 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1679  hypothetical protein  21.91 
 
 		 501 aa  54.3  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.6131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3214  hypothetical protein  25.48 
 
 		 661 aa  50.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  28.41 
 
 		 330 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  27.64 
 
 		 331 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>