22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3056 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3056  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0985  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  63.64 
 
 		 77 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4270  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  62.34 
 
 		 77 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0902743  normal  0.118236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0579  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  59.21 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3610  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  61.84 
 
 		 76 aa  98.2  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.429024  normal  0.027299 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2889  transcriptional regulator, AbrB family  58.67 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0461439  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2509  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  58.67 
 
 		 77 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3974  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5964  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.16 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3976  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.16 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00576537  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4391  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44.16 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4024  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  47.37 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.738162  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  44.74 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0694  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  44 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  50 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.29 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  32.88 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  66.67 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1016  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  53.49 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.110199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  51.52 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.95 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  45.95 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>