43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2124 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  84.36 
 
 		 222 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  84.36 
 
 		 222 aa  337  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  52.06 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  52.43 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 237 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  44.39 
 
 		 236 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  43.32 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  42.49 
 
 		 234 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  42.72 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  42.73 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  44.65 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  44.65 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  43.48 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  43.48 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  39.15 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  28.14 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  31.66 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  29.79 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  31.44 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  29.93 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  30.16 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  29.1 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  29.3 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  30.09 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2012  hypothetical protein  27.49 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2339  hypothetical protein  31.63 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.039929  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  26.98 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>