24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1301 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1301  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1236  hypothetical protein  85.16 
 
 		 131 aa  229  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1175  hypothetical protein  83.59 
 
 		 131 aa  228  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.399464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0790  hypothetical protein  58.27 
 
 		 131 aa  147  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606872  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0934  hypothetical protein  51.56 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.5 
 
 		 338 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4145  hypothetical protein  30.51 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0443  hypothetical protein  32.61 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0323  putative RNase H  33.04 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00762994  normal  0.0205227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4440  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251753  normal  0.785852 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02448  hypothetical protein  31.86 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0142  hypothetical protein  26.72 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0126  hypothetical protein  25.71 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2113  hypothetical protein  34.21 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0852  hypothetical protein  31.13 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1152  hypothetical protein  27.83 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  25.42 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59590  hypothetical protein  24 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132336  hitchhiker  4.1623000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0989  hypothetical protein  22.14 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.022347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3649  hypothetical protein  27.19 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2447  putative RNase H  28.81 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0162  hypothetical protein  26.53 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2812  hypothetical protein  25.64 
 
 		 124 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>