20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05317 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05317  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  303  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.675119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4247  hypothetical protein  74.42 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4135  putative transmembrane protein  74.42 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4117  hypothetical protein  48.06 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000467794  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2389  hypothetical protein  47.66 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0969  hypothetical protein  45.74 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0219351  normal  0.234882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0531  hypothetical protein  44.96 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1009  hypothetical protein  44.96 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0881  hypothetical protein  46.83 
 
 		 129 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.691837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0869  hypothetical protein  45.07 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0478  hypothetical protein  46.56 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.492796  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0144  hypothetical protein  46.56 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1002  hypothetical protein  46.56 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2632  hypothetical protein  46.56 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2937  hypothetical protein  45.8 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000524885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3001  hypothetical protein  44.62 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0405759  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3038  hypothetical protein  44.62 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000389489  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1597  hypothetical protein  44.16 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000856249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0680  hypothetical protein  39.83 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.766196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2061  putative lipoprotein  33.61 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0141524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>