13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03756 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  872    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  83.8 
 
 		 428 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  81.34 
 
 		 434 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  24.76 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  21.37 
 
 		 468 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  22.56 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  22.84 
 
 		 472 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  23.87 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  22.25 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  21.94 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  21.94 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  24.09 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  23.26 
 
 		 429 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>