10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01677 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01677  putative signal peptide protein  100 
 
 		 337 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.536357 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  24.12 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  27.11 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  23.79 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  24.71 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  25.08 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9277  predicted protein  25.11 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  23.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  22.08 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0162  S1/P1 nuclease  21.88 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>