45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3873 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  92.39 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  85.87 
 
 		 92 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  84.44 
 
 		 88 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  90.12 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  85.37 
 
 		 85 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  82.35 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  64.56 
 
 		 109 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  62.96 
 
 		 86 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  61.73 
 
 		 86 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  54.35 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  55.32 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  54.35 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  57.32 
 
 		 106 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  54.43 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  55 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  54.12 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  58.11 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  48.31 
 
 		 93 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  46.59 
 
 		 93 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  45.45 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  60.49 
 
 		 108 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  53.85 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  53.85 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  53.95 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  44.94 
 
 		 91 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  52.56 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  47.44 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  46.05 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  45.33 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  38.89 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  49.35 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  37.5 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  37.78 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  44.16 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3160  hypothetical protein  30.95 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0552174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0125  hypothetical protein  37.04 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  32.81 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  35.56 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69820  hypothetical protein  34.09 
 
 		 86 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.240173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  35.9 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>