9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2799 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2799  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13061  normal  0.226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2754  hypothetical protein  86.57 
 
 		 353 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3198  hypothetical protein  81.36 
 
 		 354 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2500  hypothetical protein  72.11 
 
 		 356 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0355  hypothetical protein  22.47 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4264  neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding  21.66 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal  0.280459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0273  hypothetical protein  22.02 
 
 		 343 aa  62  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4110  hypothetical protein  18.75 
 
 		 367 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00135507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4071  hypothetical protein  18.75 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>