20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2739 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2739  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0059  hypothetical protein  70.99 
 
 		 130 aa  187  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1605  putative exported protein of unknown function  75.57 
 
 		 131 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3641  hypothetical protein  80.77 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3428  hypothetical protein  82.69 
 
 		 130 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3129  hypothetical protein  54.46 
 
 		 135 aa  123  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3974  hypothetical protein  52.21 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890346  normal  0.211994 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4219  hypothetical protein  46.4 
 
 		 135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.860322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4593  hypothetical protein  51.38 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434724  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9867  hypothetical protein  54.05 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1852  hypothetical protein  48.31 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4659  hypothetical protein  45.24 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4831  hypothetical protein  50.93 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4110  hypothetical protein  52.88 
 
 		 131 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3811  hypothetical protein  50.91 
 
 		 134 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4357  hypothetical protein  46.34 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513388  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1101  hypothetical protein  45.61 
 
 		 134 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2565  hypothetical protein  45.19 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.339872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1021  hypothetical protein  46.3 
 
 		 182 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 518 aa  81.6  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>