24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2438 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  66.92 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  59.09 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  60.66 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  48.65 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  54.84 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  47.27 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  54.84 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  65.38 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  29.93 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  51.61 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  64 
 
 		 135 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  69.23 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  55.56 
 
 		 127 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  61.54 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  61.54 
 
 		 155 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  55.56 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  41.82 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1466  hypothetical protein  45.24 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  41.82 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_004310  BR1516  hypothetical protein  45.24 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  41.82 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  51.52 
 
 		 223 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3533  BA14K family protein  46.88 
 
 		 269 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100217  normal  0.403993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>