13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0781 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0781  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0858  hypothetical protein  80.38 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6947  hypothetical protein  51.9 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5629  hypothetical protein  51.23 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2610  hypothetical protein  43.59 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30470  hypothetical protein  38.12 
 
 		 568 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1177  hypothetical protein  35.96 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3199  hypothetical protein  35.91 
 
 		 453 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0524  hypothetical protein  35.27 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0334613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3495  hypothetical protein  32.54 
 
 		 452 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5217  hypothetical protein  32.98 
 
 		 437 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13453 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02660  hypothetical protein  34.15 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  22.4 
 
 		 702 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>